天然气管道离窗口两米存在安全隐患。依据《天然气管道保护法规》，管道安全距离为线路中心线两侧各五米，两米距离不满足要求，可能引发安全事故，如泄漏、爆炸等。
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有隐患需处理。操作如下：1.与天然气公司协商，看是否能移位；2.若不能移位，加强窗户等防护措施；3.如有损失，可依据法规申请补偿。需确保处理符合《天然气管道保护法规》。
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处理天然气管道安全隐患，常见方式有协商移位、加强防护或申请补偿。应根据管道位置、安全影响及法规要求，选择合适方式处理。